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MiXCR 是一个基于新一代测序（NGS）数据的免疫分析软件平台。该平台被大多数大型制药公司用于疫苗开发、抗体发现及癌症免疫治疗研究的研发工作。

MiXCR 提供了一个从原始测序数据到生物学解读的无缝分析流程。它兼容各类湿实验室方案和数据类型，能够从带或不带分子标签的靶向扩增子测序方案、鸟枪法测序与RNA-Seq文库，以及多种单细胞技术中提取免疫受体谱，并可灵活调整以适应任何定制化实验方案。

MiXCR 提供开箱即用的专用分析流程，支持所有主流商业厂商的试剂盒、标准测序数据类型及广泛采用的公共实验方案。整个分析流程只需一行命令即可轻松执行。示例如下:

10x Genomics Takara Bio RNA-Seq data

mixcr analyze 10x-vdj-bcr \
                            --species hsa \
                            in_R1.fq.gz \
                            in_R2.fq.gz \
                            output

mixcr analyze takara-human-bcr-full-length \
                              in_R1.fq.gz \
                              in_R2.fq.gz \
                              output

mixcr analyze rnaseq-cdr3 \
                              --species hsa \
                              in_R1.fq.gz \
                              in_R2.fq.gz \
                              output

MiXCR 提供的下游分析包括：

数据标准化
新等位基因变异推断
B细胞谱系重建
多种类型受体谱分析
强大的受体谱重叠分析功能

我们还推出了 Platforma——一个用于强大数据分析和可视化的无代码生物信息学平台。您可以直接在 Platforma 上运行 MiXCR，并使用诸如克隆型聚类和受体谱多样性分析等全新的下游功能，而无需使用命令行。